De partners van het Drielandenpark (3LP) werken samen op basis van een samenwerkingsovereenkomst, die om de 4 jaar wordt vernieuwd. Van deze samenwerkingsovereenkomst is het strategisch plan een hoofdonderdeel dat thematische prioriteiten definieert en een tijdschema voorziet.
De organen van het Drielandenpark zijn de stuurgroep, de projectgroep en de projectleiding. De stuurgroep bestaat uit de vertegenwoordigers van de partners met beslissingsbevoegdheid en vergadert eenmaal per jaar. De stuurgroep beslist over de samenstelling, het budget, de strategie en het tijdschema en de hoofdactiviteiten van het 3LP. De projectgroep bestaat uit de ambtelijke vertegenwoordigers van de partners en vergadert ongeveer driemaal per jaar.
De projectgroep en de projectleiding zetten de activiteiten op van het Drielandenpark en voeren deze samen met andere organisaties of werkgroepen uit. De Euregio Maas-Rijn is leidende partner en rechtspersoon van het Drielandenpark. Deze werft de projectleider aan en neemt het beheer waar van de financiële middelen.